Solvent control | MMC | |||
---|---|---|---|---|
WT TK+/- | KO TK+/- | WT TK+/- | KO TK +/- | |
Base substitution | ||||
Transition | ||||
A:T → G:C | 10 (36) | 11 (26) | 6 (6) | 5 (4) |
G:C → A:T | 1 (4) | 2 (5) | 5 (5) | 4 (3) |
Transversion | ||||
A:T → T:A | 0 (0) | 2 (5) | 1 (1) | 0 (0) |
A:T → C:G | 0 (0) | 2 (5) | 4 (4) | 1 (1) |
G:C → T:A | 3 (11) | 10 (23) | 10 (11) | 17 (13) |
G:C → C:G | 0 (0) | 1 (2) | 8 (9) | 9 (7) |
Tandem | ||||
GG:CC → CT:GA | 0 (0) | 0 (0) | 3 (3) | 2 (2) |
GG:CC → TT:AA | 0 (0) | 0 (0) | 8 (9) | 6 (5) |
GG:CC → AT:TA | 0 (0) | 0 (0) | 2 (2) | 0 (0) |
CA:GT → TG:AC | 1 (4) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
AG:TC → CT:GA | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (1) |
Frameshift (+1) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (1) | 1 (1) |
Frameshift (+2) | 1 (4) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
Frameshift (−1) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 2 (2) |
LOH | 12 (43) | 15 (35) | 43 (46) | 78 (62) |
Unidentified | 0 (0) | 0 (0) | 2 (2) | 0 (0) |
Total | 28 (100) | 43 (100) | 93 (100) | 126 (100) |